ВАЛИДАЦИЯ ПОЛИМОРФНОГО ВАРИАНТА RS10455025 ГЕНА TSLP С РАЗВИТИЕМ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ В РОССИЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ
Аннотация
Актуальность. Бронхиальная астма (БА) – это хроническое воспалительное заболевание дыхательной системы, в развитии которого ведущая роль отводится тучным клеткам, эозинофилам и Т-лимфоцитам. Распространенность БА неоднородна и составляет от 4 до 35% населения. Данное заболевание можно отнести к болезням цивилизации, так как наибольший процент пациентов, страдающих патологией дыхательной системы наблюдается в экономически развитых районах, например, в России заболеваемость варьирует от 1 до 10%, а в некоторых промышленных районах до 30%. Причем, на возраст до 10 лет приходится 34% заболевших, от 10 до 20 лет – 14%, а у пациентов в возрасте от 20 до 40 лет эта цифра достигает 17%. Такое повышенное проявление этого заболевания детского населения в раннем возрасте к моменту полового созревания или становится менее выраженным, или полностью исчезает.
Цель: исследовать ассоциацию полиморфного варианта rs10455025 гена TSLP, установленного в результате GWAS, с риском развития БА в российской популяции.
Материал и методы. В исследование была включена выборка из 851 неродственного ребенка, включающая 474 пациента с подтвержденным диагнозом БА и относительно здоровыхдетей. Все пациенты были славянского происхождения и уроженцами Курской области. Пациенты проходили лечение в отделениях Курской областной детской клинической больницы. Для выделения геномной ДНК у всех пациентов проводился забор венозной крови. Генотипирование SNP rs10455025 гена TSLP проводилось на генетическом анализаторе MassARRAY-4 (AgenaBioscience, США) в НИИ генетической и молекулярной эпидемиологии Курского государственного медицинского университета. Ассоциации полиморфизма с риском развития БА исследовались методом логистической регрессии с расчетомот ношения шансов (OR) и 95% доверительных интервалов (CI), с использованием статистического пакетаSNPStats.
Результаты исследования. Частоты генотипов SNP rs10455025 гена TSLP находились в равновесии Харди-Вайнберга в обеих группах пациентов (P>0,05). Различия в частоте минорного аллеля между группами больных БА и здоровых детей не обнаружено. В то же самое время установлено, что носительство генотипов rs10455025C/A-C/C гена TSLP ассоциировалось с повышенным риском развития бронхиальной астмы у детей (OR=1,34 95%CI1,02-1,76, P=0,03) независимо от пола и возраста пациентов.
Заключение. Ранее известная ассоциация полиморфизма rs10455025 с риском развития БА успешно подтвердилась в российской популяции, хотя сила связи данного SNP с развитием БА была слабо выраженной. Необходимы дальнейшие исследования данного полиморфизма на других популяциях России, а также требуется проведение функционального аннотирования данного SNP и оценка его патофизиологической вовлеченности в развитие болезни.
Relevance. Bronchial asthma (BA) is a chronic inflammatory disease of the respiratory system, in the development of which the leading role is assigned to mast cells, eosinophils and T lymphocytes. The prevalence of AD is heterogeneous and ranges from 4 to 35% of the population. This disease can be attributed to diseases of civilization, since the largest percentage of patients suffering from pathology of the respiratory system is observed in economically developed areas, for example, in Russia the incidence varies from 1 to 10%, and in some industrial areas up to 30%. Moreover, 34% of patients under the age of 10 years old account for, 14% from 10 to 20 years old, and in patients aged 20 to 40 years, this figure reaches 17%. Such an increased manifestation of this disease in the child population at an early age by the time of puberty either becomes less pronounced or disappears completely.
The aim of the study was to investigate the association of the polymorphic variant rs10455025 of the TSLP gene, established as a result of GWAS, with the risk of developing AD in the Russian population.
Material and methods. The study included a sample of 851 unrelated children, including 474 patients with a confirmed diagnosis of asthma and relatively healthy children. All patients were of Slavic origin and natives of the Kursk region. The patients were treated in the departments of the Kursk Regional Children's Clinical Hospital. Venous blood sampling was performed in all patients to isolate genomic DNA. The SNP rs10455025 genotyping of the TSLP gene was performed on the MassARRAY-4 genetic analyzer (AgenaBioscience, USA) at the Research Institute of Genetic and Molecular Epidemiology of Kursk State Medical University. Associations of polymorphism with the risk of developing AD were studied by the method of logistic regression with the calculation of odds (OR) and 95% confidence intervals (CI), using the statistical package SNPStats.
The results of the study. The frequencies of the SNP rs10455025 genotypes of the TSLP gene were in the Hardy-Weinberg equilibrium in both groups of patients (P>0.05). There were no differences in the frequency of the minor allele between the groups of AD patients and healthy children. At the same time, it was found that the carriage of rs10455025C/A-C/C genotypes of the TSLP gene was associated with an increased risk of developing bronchial asthma in children (OR=1.34 95%CI1.02-1.76, P=0.03) regardless of the gender and age of patients.
Conclusion. The previously known association of rs10455025 polymorphism with the risk of developing AD was successfully confirmed in the Russian population, although the strength of the association of this SNP with the development of AD was weakly expressed. Further studies of this polymorphism in other populations of Russia are needed, and functional annotation of this SNP and assessment of its pathophysiological involvement in the development of the disease are also required.
Ключевые слова
Об авторах
Александра Владимировна СережкинаРоссия
ассистент кафедры педиатрии КГМУ
Алексей Валерьевич Полоников
Россия
д.м.н., профессор кафедры биологии, медицинской генетики и экологии
Дарья Руслановна Яковлева
Россия
студентка 5 курса лечебного факультета
Список литературы
1. Абросимов В.Н. Бронхиальная астма и функциональные нарушения дыхания: синдром «бронхиальная астма-плюс». Пульмонология. 2018;28(6):722-729. DOI: 10.18093/0869-0189-2018-28-6-722-729. EDN: ZAHMZN.
2. Гулиева Г.Р., Петров М.В., Петров Р.В. Бронхиальная астма, приступ бронхиальной астмы (первая помощь). Вестник научных конференций. 2016;11-6(15):54-56. EDN: XICLVT.
3. Хаитов Р.М., Ильина Н.И. Аллергология и иммунология: национальное руководство. Москва: ГЭОТАР-Медиа, 2009. 656с.
4. Bisdorff B., Kenn K., Nowak D., Schlichtiger J., Bäuml J., Orban E., Radon K. Asthma and vocal cord dysfunction related symptoms in the general population – a pilot study. Ann. Allergy Asthma Immunol. 2014;113(5):576–577. DOI: 10.1016/j.anai.2014.08.009.
5. Chang D., Hunkapiller J., Bhangale T., Reeder J., Mukhyala K., Tom J., Cowgill A., Vogel J., Forrest W.F., Khan Z., Stockwell A., McCarthy M.I., Staton T.L., Olsson J., Holweg C.T.J., Cheung D.S., Chen H., Brauer M.J., Graham R.R., Behrens T., Wilson M.S., Arron J.R., Choy D.F., Yaspan B.L.. A whole genome sequencing study of moderate to severe asthma identifies a lung function locus associated with asthma risk. Sci Rep. 2022;12(1):5574. DOI: 10.1038/s41598-022-09447-8.
6. Fretzayas А., Moustaki М., Loukou I., Douros K. Differentiating vocal cord dysfunction from asthma. J. Asthma Allergy. 2017;(10):277–283. DOI: 10.2147/JAA.S146007.
7. Thomsen S.F. Genetics of asthma: an introduction for the clinician. Eur Clin Respir J. 2015;2(1):24643. DOI: 10.3402/ecrj.v2.24643.
8. Vuckovic D., Bao E.L., Akbari P., Lareau C.A., Mousas A., Jiang T., Chen M., Raffield L.M., Tardaguila M., Huffman J.E., Ritchie S.C., Megy K., Ponstingl H., Penkett C.J., Albers P.K., Wigdor E.M., Sakaue S., Moscati A., Manansala R., Lo K.S., Qian H., Akiyama M., Bartz T.M., Ben-Shlomo Y., Beswick A., Bork-Jensen J., Bottinger E.P., Brody J.A., van Rooij F.G.A., Chitrala K.N., Wilson P.W.F., Choquet H. The Polygenic and Monogenic Basis of Blood Traits and Diseases. Cell. 2020;182(5):1214-1231.e11. DOI: 10.1016/j.cell.2020.08.008.
9. Yoon D., Ban H., Kim Y., Kim E., Kim H., Han B., Park J., Hong S., Cho S., Park K., Lee J. Replication of genome-wide association studies on asthma and allergic diseases in Korean adult population. BMB Rep. 2014;45(5):305-310. DOI: 10.5483/BMBRep.2012.45.5.305.
Рецензия
Для цитирования:
Сережкина А.В., Полоников А.В., Яковлева Д.Р. ВАЛИДАЦИЯ ПОЛИМОРФНОГО ВАРИАНТА RS10455025 ГЕНА TSLP С РАЗВИТИЕМ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ В РОССИЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ. Вектор молодежной медицинской науки. 2024;1(1):194-198.